Pomysł uruchomienia pociągu papieskiego zrodził się podczas III ogólnopolskiej pielgrzymki polskich kolejarzy do Sanktuarium Miłosierdzia Bożego w Krakowskich Łagiewnikach w dniu 3 września 2005 roku. Jego autorem jest kolejarz z wykształcenia, kapłan z powołania, duszpasterz kolejarzy archidiecezji warszawskiej i animator Katolickiego Stowarzyszenia Kolejarzy Polskich - ks. Ryszard Marciniak SAC

W pierwszej wersji, tradycyjny pociąg pomalowany w barwy papieskie, miał spełniać przede wszystkim funkcję komunikacyjną i służyć usprawnieniu połączenia kolejowego Wadowic z Krakowem. Chcieliśmy aby z Wadowic, z miejsca narodzin i młodości Papieża, każdy pielgrzym i turysta mógł bez problemów poprzez Kalwarię Zebrzydowską z jej Sanktuarium Pasyjno-Maryjnym, dotrzeć do Krakowa, skąd Opatrzność Boża powołała ks. kard. Karola Wojtyłę na stolicę św. Piotra w Rzymie.

Ostatecznie, papieski pociąg "Totus Tuus" uzyskał nie tylko nowoczesną sylwetkę i ciepłą kolorystykę (patrz galeria fotograficzna) ale stał się pojazdem na pokładzie którego, każdy z podróżnych może spotkać Sługę Bożego Jana Pawła II w Jego nauczaniu i działalności.

Stoimy ciągle wobec aktualnego zaproszenia Jana Pawła II do wypełnienia misji wielkiej wiosny chrześcijaństwa, nowej ewangelizacji, budowania cywilizacji miłości. To zadanie zostało powierzone nie tylko bezpośrednim świadkom Jego pontyfikatu ale i tym co nie mieli możliwości osobistego z Nim spotkania.

Multimedialne studio, stanowiące serce pociągu, pozwala poprzez sieć głośników i kolorowych monitorów przekazać wszystkim uczestnikom przejazdu zarówno informacje o wybranych wydarzeniach z pontyfikatu Jana Pawła II jak zapoznać z najważniejszymi tematami papieskiego nauczania. Nośnikami informacji są filmy, prezentacje audiowizualne a często także żywy głos.

Jesteśmy dumni z tego, że projekt pociągu papieskiego wykonał zespół bardzo młodych inżynierów
z krakowskiej firmy EC Engineering należącej do grupy ENERGOCONTROL, natomiast jego zbudowaniem, w rekordowo krótkim czasie czterech miesięcy, może się pochwalić nowosądecki NEWAG (dawne ZNTK Nowy Sącz).

Ten wyjątkowy, jedyny na świecie pojazd, został w dniu 27 maja 2006 roku, pobłogosławiony
w Krakowie Łagiewnikach przez Ojca Świętego Benedykta XVI jako kolejarskie wotum za pontyfikat Ojca Świętego Jana Pawła II.

2 czerwca 2006 roku, a więc 9 miesięcy od zaprezentowania pomysłu, przy obecności Jego Eminencji
ks. kard. Stanisława Dziwisza na pokładzie, rozpoczął służbę na kolejowych szlakach Polski i Europy.

Od tego dnia Jan Paweł II zaprosił na pokład pociągu papieskiego wielu biskupów z Polski i z zagranicy, w tym także z Watykanu. W tej wyjątkowej i niepowtarzalnej audiencji z Papieżem Polakiem uczestniczyło już ponad 300 tys. zarówno indywidualnych osób jak i zorganizowanych grup pielgrzymów i turystów z różnych stron Polski, Europy a także z pozostałych kontynentów.

Dzięki współczesnej technice, Jan Paweł II realizuje swoją misję głównie na kolejowym szlaku Jana Pawła II z Wadowic do Krakowa. W czasie przejazdu przygotowuje podróżujących papieskim pociągiem do bardziej racjonalnego, bardziej owocnego spotkania z Nim w tych miejscach, które kształtowały Jego wielkie serce.

Ale tak jak nie ograniczał swoich pielgrzymek do Rzymu i okolic tak dzięki fantazji i zapałowi wielu prawdziwych Jego miłośników realizuje swe duszpasterskie wizyty i poza terenem Małopolski. Był już
m. innymi w Warszawie, Częstochowie, Białymstoku, Opolu, Wrocławiu a nawet w Zilinie, Koszycach czy Zwoleniu na Słowacji.

W dniach 11 do 18 maja 2009 Pociąg Papieski ponownie zawitał do Białegostoku a w ostatnie dni maja 2009 po raz pierwszy na Górny Śląsk. W obu odwiedzanych  miejscach, na kolejno odwiedzanych stacjach, witany był przez starostów, prezydentów miast, burmistrzów, wójtów, przedstawicieli hierarchii Kościoła katolickiego, dziekanów, proboszczów wraz z rzeszami mieszkańców. Te szczególne spotkania z Janem Pawłem II ubogacały chóry, orkiestry, zespoły ludowe i taneczne.

W dniach od 6 do 10 czerwca 2009 roku, szlakiem pielgrzymki z 1999 roku, dotarł do Bydgoszczy, Torunia, Włocławka, Tczewa, Malborka, Pelplina, Wejherowa, Lęborka.  11 czerwca 2009, dokładnie w 22 rocznicę, nawiedził  Szczecin a w kolejnych dniach Goleniów, Gryfino, Stargard Szczeciński i Choszczno.

Gdzie pojedzie znowu? To wszystko zależy od Was.

Na razie, do końca sierpnia 2009 we wszystkie dni tygodnia, za wyjątkiem poniedziałków, będzie kursował na kolejowym szlaku  Jana Pawła II z Wadowic do Krakowa.